Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xab2Q9DCD2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms