Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms