Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg8Q9DBM0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms