Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Med27Q9DB40 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms