Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift43Q9DA69 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms