Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmbim4Q9DA39 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmbim4Q9DA39 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmbim4Q9DA39 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmbim4Q9DA39 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms