Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms