Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D8Q6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms