Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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