Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl17Q9D8P4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms