Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan13Q9D8C2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms