Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fip1l1Q9D824 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fip1l1Q9D824 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms