Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cldn22Q9D7U6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn22Q9D7U6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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