Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem54Q9D7S1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem54Q9D7S1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem54Q9D7S1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem54Q9D7S1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem54Q9D7S1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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