Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmigd1Q9D7L8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tmigd1Q9D7L8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms