Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4cQ9D7F7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms