Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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