Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl40Q9D783 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms