Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip1Q9D620 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11fip1Q9D620 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms