Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4f1Q9D5Q6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms