Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lonrf3Q9D4H7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms