Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D454 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D454 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D454 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D454 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D454 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms