Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pus10Q9D3U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms