Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms