Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bcas2Q9D287 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Bcas2Q9D287 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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