Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chordc1Q9D1P4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms