Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms