Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms