Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Upk1aQ9D132 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Upk1aQ9D132 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Upk1aQ9D132 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Upk1aQ9D132 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk1aQ9D132 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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