Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms