Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms