Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Zbed3Q9D0L1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms