Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms