Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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