Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc77Q9CZH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms