Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gins3Q9CY94 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gins3Q9CY94 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gins3Q9CY94 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins3Q9CY94 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms