Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChtopQ9CY57 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms