Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Prdm5Q9CXE0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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