Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pin4Q9CWW6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pin4Q9CWW6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms