Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mcm8Q9CWV1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mcm8Q9CWV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms