Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms