Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BccipQ9CWI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BccipQ9CWI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BccipQ9CWI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms