Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310003L06RikQ9CV82 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms