Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sycp2Q9CUU3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms