Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930519P11RikQ9CUJ8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms