Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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