Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard3bQ9CSB4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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