Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms