Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccer1Q9CQL2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms