Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms